@Diyorki さん、こんにちは。
確かに、デフォルトテーマの方が優れています。デフォルトテーマを「骨格」と考えてください。それをカスタマイズできるのです。つまり、これらのテーマは主にデフォルトテーマに「皮膚」を追加するだけのものです。サイトデザインを変えたり、他の機能を追加したりしたい場合は、Customization > Theme や Customization > Theme component が必要です。これらのテーマは、SEO に悪影響を及ぼす可能性のあるコア機能を変更することはほとんどありません。ただし、シンプルな CSS スタイルリングでも同様の問題を引き起こす可能性はありますが、そのような問題に気づいた場合は修正できます。
テーマを有効にしたときに何か問題が発生した場合は、いつでもデフォルトテーマに戻すことができます。デフォルトテーマとは別に、オプションのテーマとして複数のテーマを使用できます。ユーザーは異なるテーマから選択できますが、サイトのデフォルトテーマは引き続きデフォルト（ライト）のままです。