Die einfachste Lösung hier ist spezifisch für das Docker-Manager-Plugin. Ich bin mir nicht sicher, wie ich zu der Idee stehe, bei jedem Plugin bei jedem Start einen zusätzlichen Git-Befehl auszuführen oder nach Git-Remotes zu suchen.
Aber das Docker-Manager-Plugin könnte diese zusätzliche Arbeit übernehmen und ein großes rotes Symbol bei offiziellen Plugins anzeigen, die geforkt zu sein scheinen.
Ich werde 
für das nächste Release einplanen, sodass dies in den nächsten 6 Monaten oder so geschehen wird.
pr-welcome auch, falls jemand am Docker-Manager herumspielen möchte.