このディスコースインスタンスではGitHubのパーマリンク書き換えが無効になっているため、有効なテストではありません。（「公式」インスタンスで無効になっている場合、この機能について何を物語っているのかと思います 
）
代わりに、この例をreplace_github_non_permalinks.rb / replace_github_non_permalinks_spec.rbのテストケースとして記述した場合、そのリンクも書き換えられることがわかると思います。
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