Лицензия GPL для модифицированного Discourse на собственном сайте

Кажется, вы упускаете суть? Если вы создадите плагин на GitHub и разместите его в приватном репозитории, у вас будет полный контроль над модификациями Discourse (хотя и через подход плагинов), а также полная собственность и контроль над этими изменениями. Никто другой их не увидит, и вам не стоит опасаться каких-либо юридических последствий, насколько мне известно. При этом вы сможете использовать преимущества поддерживаемых изменений ядра.

Плагин даёт вам возможность изменять как фронтенд, так и бэкенд.

Форк и модификация Discourse очень быстро превратятся в хаос, независимо от юридической ситуации, поэтому такой подход не рекомендуется.