Oui, le !important annule tout autre CSS sans !important… Je ne me souviens plus pourquoi il est là, mais je devrais vérifier pour le supprimer. Est-ce que cela fonctionne si vous incluez un !important dans votre propre CSS ?
.d-header #site-logo {
max-height: 50px !important; // <-- votre hauteur personnalisée ici
}