Ao visualizar no Tema Escuro, imagens transparentes não funcionam muito bem.
Existe alguma sintaxe Markdown para definir uma cor de fundo para uma imagem ou outra maneira de lidar com isso?
Isso não tem realmente nada a ver com temas. Use uma imagem com transparência adequada definida (mistura alfa, não fixa) ou troque as imagens por tema.
O logotipo do Discourse, por exemplo, precisa ser invertido manualmente para funcionar em um tema escuro: o preto é convertido em branco, mas as demais cores permanecem inalteradas.
Se você estiver falando de imagens em posts, pode aplicar uma cor de fundo via CSS nas configurações do seu tema.
Por exemplo:
.cooked img {
background-color: white;
}
Mas isso afetará todas as imagens.