Спасибо всем за ответы — не уверен, где я это прочитал, но всегда думал, что нужно устанавливать по 2 рабочих процесса на ядро. Сейчас я уменьшил количество рабочих процессов для каждого раздела, распределив больше для самых загруженных и меньше для менее активных. В течение следующей недели я буду следить за ситуацией и отпишусь, если это не поможет.
Редактирование: Кажется, я читал об этом здесь.