¿Tienes el explorador de datos en tu sitio? Si es así, deberías poder extraer esos números con algo como esto:
SELECT t.category_id,
COUNT(t.category_id)-1 AS topics
FROM topics t
JOIN categories c ON c.id = t.category_id
WHERE t.deleted_at IS NULL
AND t.visible = true
AND c.post_count IS NOT NULL
GROUP BY c.position, t.category_id
ORDER BY c.position
Este no cuenta los temas no listados o eliminados, e ignora las categorías eliminadas basándose en el recuento de publicaciones NULL. También está en orden de ‘posición’, lo que puede no ser tan útil si no has establecido posiciones fijas.
(He añadido un ‘-1’ para tener en cuenta el tema “Acerca de”)