Cloudflare отлично работает в режиме DNS только. Если вы хотите использовать оптимизацию Cloudflare, убедитесь, что вы отключили кэширование, приложения и производительность через правило страницы (также отключите Rocket Loader).
Помимо этого, вам нужно определять оригинальный IP-адрес пользователя, а не прокси-IP Cloudflare, чтобы избежать ограничения скорости из-за большого количества запросов, поступающих с одного IP-адреса.