¡Nunca he usado ese plugin! 
Sin embargo, al leer el tema en Discourse Who's Online y el código en https://github.com/discourse/discourse-whos-online/blob/main/assets/javascripts/discourse/components/whos-online.js, supongo que es lo mismo, pero configurable a través de la configuración (en este caso, whos_online_active_timeago).
En cuanto a cómo interactúan…
¿Utilizas el plugin actualmente? Si el temporizador de configuración de tu plugin está configurado en 60 segundos, es posible que no haya forma de saber qué sistema está estableciendo el borde activo en los avatares. 