Non esiste un “prima” o un “dopo”. Funzionano in parallelo (categorie e tag). Non importa se un utente seleziona i tag prima o dopo aver inserito alcune categorie specifiche.
Se inseriscono le categorie desiderate e selezionano i tag solo dopo, alla fine il risultato sarà lo stesso. Le categorie non verranno filtrate solo dai tag mentre le si inserisce, ma probabilmente non è molto importante.
Se ti riferisci solo all’esperienza utente, alla visualizzazione delle caselle per la selezione, immagino che sia possibile passare abbastanza facilmente: i tag a sinistra della selezione delle categorie, e non a destra. Anche se ciò richiederebbe un tema o CSS.