エイリアスが変更されました。現在は複数の TOTP が存在するためです。また、そのコマンドは全ユーザーのすべての TOTP インスタンスを削除してしまいます。おそらく、2 つ目のコマンドとして以下を実行したいでしょう:
UserSecondFactor.totps.where(user_id: id).each(&:destroy!)
エイリアスが変更されました。現在は複数の TOTP が存在するためです。また、そのコマンドは全ユーザーのすべての TOTP インスタンスを削除してしまいます。おそらく、2 つ目のコマンドとして以下を実行したいでしょう:
UserSecondFactor.totps.where(user_id: id).each(&:destroy!)