Todos los demás tienen la etiqueta del generador. Esa es la forma oficial y única admitida de obtener la versión.
Pero la diferencia que ves en el objeto Discourse.application.APP.version se debe a Las nuevas instalaciones usarán por defecto compilaciones de Ember CLI en producción, que Meta ya está ejecutando pero que solo se implementará en sitios antiguos en unas pocas semanas.