Es posible personalizar la plantilla de correo electrónico externa que se utiliza como contenedor para todos los correos enviados desde Discourse. Esto te permite añadir tu marca a los correos enviados desde tu sitio. Los detalles sobre cómo hacerlo están aquí: Customizing the Discourse outer email template.
Si utilizas este enfoque, probablemente querrás desactivar la configuración del sitio apply custom styles to digest para que los correos de resumen enviados desde tu sitio no muestren tu marca dos veces.