No estoy seguro de cómo ocurrió eso. El proceso de restauración omite todo el código relacionado con las subidas (incluida la reescritura de las URL de las subidas) cuando restauras un archivo .sql.gz.
¿Quizás estamos hablando de cosas diferentes? Me refiero a la columna url en la tabla uploads, que normalmente es //tu-s3-bucket/original/... frente a /uploads/original en local.
Una advertencia al restaurar un archivo .sql.gz es que no se reescriben las URL en absoluto. Se espera que el servidor sea accesible a través del mismo nombre de host que el servidor donde se creó la copia de seguridad. Necesitarás volver a mapear las URL si cambias los nombres de host.