Não tenho certeza de como isso aconteceu. O processo de restauração ignora todo o código relacionado aos uploads (incluindo a reescrita das URLs de upload) ao restaurar um arquivo .sql.gz.
Talvez estejamos falando de coisas diferentes? Estou me referindo à coluna url na tabela uploads, que normalmente é //seu-bucket-s3/original/... versus /uploads/original no ambiente local.
Uma ressalva ao restaurar um arquivo .sql.gz é que nenhuma URL é reescrita. Ele espera que o servidor seja acessível pelo mesmo hostname do servidor onde o backup foi criado. Você precisará remapear as URLs se alterar os hostnames.