ファビコンやその他のサイトアイコンが、サイトが HTTPS であるにもかかわらず HTTP で読み込まれています。Chrome はこれらのリクエストを HTTPS にアップグレードできますが、ファビコンは HTTP のままとなり、コンソールにエラーが表示されます。
編集: 設定で「HTTPS 強制」が無効になっていました。これを有効にすることで問題が解決しました。