Los temas Horizon y Foundation se añadirán a tu sitio, pero tu tema seleccionado actualmente (y sus componentes) seguirán siendo tu tema predeterminado.
Como ejemplo, acabo de actualizar un sitio personal que solo tenía un tema instalado, y esta es la página de temas resultante:
Todos mis componentes siguen en su lugar, habilitados y funcionando como antes de la actualización.