Вы имеете в виду внутренние ссылки на другие посты? Я реализовал это для некоторых импортеров. Мне кажется, проще исправить это в импортере, где сопоставление старых и новых ссылок получить легче.
Преобразование HTML в Markdown может быть проблематичным. Вам нужно посмотреть на эти примеры и решить, хотите ли вы исправить их сейчас, позже или не исправлять вовсе.