Já tive problemas com o Docker em sistemas somente IPv6 no passado relacionados à falta de NAT, já que o Docker frequentemente usa endereços IP que só são acessíveis a partir do host, mas o NAT não é configurado automaticamente pelo Docker para IPv6.
O README deste repositório descreve esse problema mais detalhadamente: GitHub - robbertkl/docker-ipv6nat: Extend Docker with IPv6 NAT, similar to IPv4