Aún no lo hemos publicado en Meta (lo haremos la próxima semana), pero puedes anular todos los colores de un tema en el archivo about.json de tu tema (consulta la sección de esquema de color en Developing Discourse Themes & Theme Components)
Puedes anular $primary y otros colores como se menciona en la publicación, pero también puedes anular colores secundarios como $primary-low, $primary-high, etc. Puedes ver todas las variables de color listadas aquí: https://theme-creator.discourse.org/styleguide/atoms/colors
Ten en cuenta que, por el momento, este nivel de anulación de colores solo está disponible en temas remotos, no en temas creados localmente en la interfaz de administración.