Welche Version verwendest du? Speicherst du Uploads auf S3 oder lokal?
Meine Vermutung ist, dass ein Bereinigungsjob eine Reihe hochgeladener Dateien entfernt hat. Ich schlage vor, dass du die Dateien für den 03.07.2019 und den 06.07.2019 extrahierst und einen Diff erstellst. Fehlt etwas, das nicht fehlen sollte?