Gracias por responderme, disculpa por no incluir detalles obvios como la versión. Estamos en la v2.3.1 +12 actualmente (canal estable, creo). El período del 2019-07-03 al 2019-07-06 podría haber cubierto fácilmente un momento en el que actualizamos y se cambió alguna lógica de respaldo. Las cargas se almacenan localmente (ya que nuestro foro es bastante pequeño, como puedes ver).
¡Genial la idea de revisar el interior de los respaldos! Aquí es donde se manifiesta la diferencia de tamaño:
% du -sh forum-190703/uploads/default/* | sort -h | tail -n 6
508K forum-190703/uploads/default/25
780K forum-190703/uploads/default/1
1.6M forum-190703/uploads/default/avatars
2.9M forum-190703/uploads/default/_optimized
86M forum-190703/uploads/default/optimized
120M forum-190703/uploads/default/original
% du -sh forum-190706/uploads/default/* | sort -h | tail -n 6
488K forum-190706/uploads/default/103
508K forum-190706/uploads/default/25
776K forum-190706/uploads/default/1
1.6M forum-190706/uploads/default/avatars
2.9M forum-190706/uploads/default/_optimized
120M forum-190706/uploads/default/original
Así que es todo el directorio optimized el que desaparece. Asumo que esto es intencional para ahorrar espacio en el respaldo, especialmente después de encontrar este commit, así que todo parece estar bien. Gracias. 