Parece que el banner se agrega a través del tema. Esto significa que, al cambiar de tema, el banner desaparecerá. En lugar de agregar el banner directamente a tu tema, puedes crear un componente de tema para el banner y luego añadir ese componente a todos los temas de tu sitio.
Puedes encontrar más detalles sobre esto al inicio de este tema: Beginner's guide to using Discourse Themes.