未読に表示されるトピックについて、少し誤解があるかもしれません。「あなたが追跡または監視していて、未読の返信があるトピック」と説明するのが適切でしょう。
おそらく問題は、トピックの通知レベルが、あなたがそれを未読としてマークする前に変更されなかったことかもしれません。未読としてマークする前に、トピックの通知ドロップダウンでそれを変更してみてはいかがでしょうか。（何かを未読としてマークした後、サイトをリロードすることも役立つかもしれません。Discourseがそれを再度表示するために必要な場合があるように感じることがあります。）私の場合、その後トピックは「新規」に戻ります。
もしそれが機能するなら、例えばトピックに入ったときにすぐに追跡するようにするなど、追跡設定を変更すると良いかもしれません。そうすれば、後で読みたいトピックに入るたびに毎回それを行う必要がなくなります。