それを修正すべきです。既存の Apache サイトがあるサーバーに Discourse を設定する方法に関するトピック(https://meta.discourse.org/t/how-to-set-up-discourse-on-a-server-with-existing-apache-sites/30013)には、その手順が記載されているかもしれません。
MaxMind のキーを設定しないだけなら、再構築時に警告が表示されますが、問題にはならないと思います。
それを修正すべきです。既存の Apache サイトがあるサーバーに Discourse を設定する方法に関するトピック(https://meta.discourse.org/t/how-to-set-up-discourse-on-a-server-with-existing-apache-sites/30013)には、その手順が記載されているかもしれません。
MaxMind のキーを設定しないだけなら、再構築時に警告が表示されますが、問題にはならないと思います。