Depende de qué te gustaría cambiar. Si quieres eliminar o reestilizar contenido, es probable que puedas hacerlo con algo de CSS adicional. Si deseas agregar información o cambiar el diseño drásticamente, entonces necesitarás editar los archivos de plantilla.
En el tema Minima, edité la plantilla de la lista de temas para reubicar o eliminar algunas avatares. Puedes verlo aquí: https://github.com/discourse/minima/blob/master/desktop/header.html
Si te gustaría usar el tema Minima y agregar personalizaciones adicionales, te recomiendo instalar Minima y añadir tus personalizaciones creando un nuevo componente de tema. De esta manera, aún podrás recibir actualizaciones de Minima sin preocuparte de que tus cambios sean sobrescritos.