Dies ist mehr Beschwichtigung als tatsächliche Hilfe, aber hier sind ein paar Ideen.
Erstens, da Sie jetzt wissen, welcher Index defekt ist, können Sie nur diesen und nicht jeden Index in der Datenbank neu indizieren. Sie könnten https://ask.discourse.com/ um einen Hinweis bitten, wie das geht.
Corrupt indexes in PG12, how do I fix? - #11 by sam enthält ebenfalls einige Hinweise.
Da Ihnen diese Linkverfolgung nicht so wichtig ist (und ich nehme an, es wurde sowieso ein neuer erstellt), ist das einfache Löschen der Duplikate in Ordnung.
Es sollte eine Möglichkeit geben, eine Abfrage durchzuführen, die die Duplikate findet, damit Sie sie alle auf einmal löschen können.