Espera. https://alltiago.com/ parece estar funcionando perfectamente. Pero esto es lo que iba a recomendar
Sí, pero es complicado. Si solicitas un certificado DIFERENTE, puedes reiniciar tu contador desde cero.
Lo que probablemente recomendaría es añadir www al nombre de host para obtener certificados para ambos (pero tal vez ya lo hayas hecho, en cuyo caso podrías añadir un tercer nombre, solo para obtener un certificado nuevo).
Set up Let’s Encrypt with multiple domains / redirects debería ayudar.