サイトには非常に価値のあるコンテンツがあり、アルゴリズムが「悪い部分」を無視しているだけかもしれません。ケースバイケースです。
GoogleがクローラーバージョンをJavaScriptバージョンと同じようにランク付けするというのは（一般的な意味では）理にかなっていません。
メニュー、おすすめトピック、サイドバーリンクがなく、ユーザープロフィール/バッジページはnoindexであり、その他多くの機能がクローラーバージョンでは利用できません。
結果が出たら新しいトピックで更新します。今のところ、SERPでのポジショニングは非常に不安定です。
編集 ユーザープロフィール/バッジページはヘッダー経由でnoindexになっています。