Acabei de testar isso no meu fórum e aqui estão os resultados:
Criei uma categoria que tinha acesso a staff e TL3, e depois uma subcategoria apenas para staff.
Criei um tópico usando a categoria TL3 com uma conta de teste, depois três com minha conta de administrador principal. Resultados abaixo.
É assim que fica do lado TL3, que pode ver a categoria pai, mas não a subcategoria privada:
Veja como fica do lado staff/admin:
E depois de perguntar a @JammyDodger, movi isso para Bug 
Tenha um ótimo fim de semana!