Sembra che tu l’abbia risolto da solo! È bello saperlo.
Per chiunque altro stia leggendo: c’era un bug introdotto poco dopo la v2.6.0.beta1. L’ho risolto in FIX: Backups should use relative paths for local uploads · discourse/discourse@f51ccea · GitHub e lo ho retroportato nel ramo beta.
D’ora in poi i backup verranno creati correttamente e anche il ripristino di un backup creato nel periodo tra la v2.6.0.beta1 e la correzione del bug funzionerà.