遅くなり申し訳ありません。問題は現在修正され、ベータ版および安定版にもバックポートされました。アセットへのパスを含む base 属性を追加し、source 属性にはファイル名のみを残すようにしました。
base
https://review.discourse.org/t/fix-ensure-sourcemaps-source-is-correct-uses-the-full-assets-path-this-time-8774/8506