Sí, creo que cambiar en un sitio establecido tendrá algunas desventajas. Especialmente para este tipo de cosas. 
Para anular la configuración predeterminada creo que necesitarías un plugin [ETA no es cierto, ver publicación a continuación] (pero creo que lo mismo ocurre con la silenciamiento de las notificaciones). No son editables en la interfaz de usuario, ya que creo que es fácil que las personas causen daños reales a su sitio con una configuración modificada de forma deficiente. El SQL de la insignia personalizada está detrás de una configuración oculta del sitio como medida de seguridad adicional.
Creo que una solicitud de función similar también ha surgido antes, lo que puede darle más peso:
(Puede haber otras también)
Una configuración en las preferencias de tu usuario similar a la de ‘Notificar cuando me gusta’ podría funcionar y mantenerlo simple. Algo como ‘Notificar cuando se gane una insignia’ - nunca | la primera vez que se gane una insignia | siempre