Nada nos impede (os autores do plugin) de categorizar corretamente os itens, como você pode ver aqui (são plugins que colocam itens em uma seção dedicada):
O problema é que, às vezes, um plugin tem apenas 1 ou 2 configurações, e atribuir uma seção inteira a ele é exagero.
A principal coisa que acho que gostaria de ver corrigida é essa bagunça, quando você clica em configurações:
/plugins?filter=affiliate
Em vez disso, talvez:
?filter=plugin:discourse-affiliate
Dessa forma, se um plugin se espalhar por vários grupos ou omitir uma palavra-chave em uma configuração, o botão ainda funcionará.
Acho que, quando os plugins registrarem configurações, o núcleo terá que rastrear no servidor qual plugin é dono de qual configuração.
Vou incluir essa mudança específica na nossa próxima versão, pois é pequena e faz uma grande diferença.