Ehm… 
Ho dimenticato la parte Nginx (Discourse). Grazie! 
Ho appena modificato app.yml ed eseguito una ricostruzione del container. Il bot è tornato quasi istantaneamente dopo che il container è stato riavviato. Non vedo ancora errori 429. Spero che rimanga così per gli utenti “normali”.
Questo è il punto… Quando controllo la pagina di amministrazione degli utenti, ho sempre visto voci diverse per l’“ultimo IP”. Quindi in qualche modo Discourse ha visto i veri IP degli utenti, anche senza mod_remoteip e anche senza la modifica della configurazione Nginx. 
Comunque, sono curioso di vedere se la modifica della configurazione Nginx ha portato alla soluzione di questo problema!