Intentaré reunir el valor para realizar todas las actualizaciones más adelante (espero) y volveré a informar.
En cuanto al tema, todo se complicó un poco. Utilizamos (y modificamos) el tema Light. Realizamos los siguientes cambios de alto nivel en los colores:
Terciario: #0088cc → #006498
Cuaternario: #e45735 → #C93C1B
Peligro: #e45735 → #C93C1B
Éxito: #009900 → #007A00
El truco inteligente que se me ocurrió tarde es simplemente probar la página de colores para verificar la accesibilidad. 
Posteriormente, realizamos una gran cantidad de cambios utilizando el editor CSS (admin/customize/themes/3/common/scss/edit) de los cuales no estoy seguro de cómo compartirlos (puedo copiar y pegar, pero no sé si eso es lo que deseas ni si quieres que lo incluya en este hilo). Creo que si pudiéramos ver los otros colores mencionados (por ejemplo, var(–primary-medium)) en una interfaz de alto nivel, las cosas podrían volverse más sencillas. Por ejemplo, un caso clásico fue #919191 –\u003e #595959, pero mi método solo trata los síntomas que de alguna manera veo al navegar por las páginas (y, además, la naturaleza dinámica del “sitio” significa que lo que funciona hoy podría no funcionar mañana).
Estoy dispuesto a intentarlo de otra manera también, solo avísame, aunque en ningún momento podré ejecutar un servicio de demostración, revisar código, etc.
También debo señalar que no pude arreglar admin/upgrade en absoluto (y tiene numerosos problemas de contraste); no estoy seguro de si no sigue el CSS o cuál es la razón.