Я не понимаю, что ты имеешь в виду, Джей. Обычный способ установки плагина — это как раз клонировать его в блоке after_code?
У меня это работает. Мне интересно, как выглядит неправильная конфигурация?
## Плагины размещаются здесь
## подробности см. по ссылке https://meta.discourse.org/t/19157
hooks:
after_code:
- exec:
cd: $home/plugins
cmd:
- git clone https://github.com/discourse/docker_manager.git
- git clone https://github.com/discourse/discourse-fontawesome-pro.git