私にもわかりません。コードを確認しても、その理由は見つかりませんでした。何かがソート順を変更しているようですが、それが何なのかは確認できません。
アップグレードを実行した際に、順序が崩れたと感じました。順序が崩れたメッセージは一般的にかなり古く、以前は期待された場所に表示されていたからです。上記の SQL を実行したときはすべて問題ないように見えたのですが、先週になって、いくつかの新しい投稿も順序が崩れて表示されるようになりました。影響を受けている投稿は、常に他の投稿への返信のようです。例：
以下のプラグインがインストールされています：
おそらく「question-answer」プラグインがソート順を変更しているのでしょうが、それは質問トピックにのみ影響し、一般的なトピックには影響しないはずです。