ああ、そんなに長くは経っていませんね。 
組み込みのユーザーフィールドも検索可能にするために、コアに変更を加えるのが完璧な解決策だと思います。カスタムフィールドの方がデフォルトフィールドよりも機能が多いというのは、少し奇妙です。
ただし、新しい設定ページ形式は、それらを組み込むのに適しているかもしれません。表示/非表示/無効にする機能や、オプションで検索可能にするなどの機能があれば、良い改善になるでしょう。
データエクスプローラーを使用してこの情報を取得できるはずですか？しかし、これは管理者レポートではなく、ユーザーベースが使用するためのものだと仮定していますか？