現在取り組んでいるアプローチでは、DiscourseのコメントをMkDocsのページに直接生成することが技術的に可能になりますが、そのためにはサーバーサイドフレームワーク（Remix、Railsなど）を使用してMkDocsのページを提供する必要があります。これにより、ドキュメントサイトでユーザーを認証し（DiscourseConnectを使用）、以前に返されたコメントをキャッシュするためインメモリデータベースを使用することも可能になります。
（編集：明確にしておくと、DiscourseをウェブサイトのIDプロバイダーとして使用することについて話しているのであって、ウェブサイトをDiscourseのIDプロバイダーとして使用することではありません。後者のアプローチは機能しますが、ほとんどのユースケースには柔軟性が低すぎます。）
しかし、それはあなたのチームに大きな変更を依頼することになります。
あなたの視点からは、これが完全にDiscourse内で達成される方が簡単でしょうが、Discourseをコンテンツ管理システムとして使用することも可能です。その場合、マークダウンドキュメントは通常のDiscourseトピックとして生成されます。DiscourseのWebhookを使用して、外部サイトでドキュメントページの生成をトリガーします。これは、現在セットアップしているDiscourseコメントデモサイトの基盤でもあります。