Parece que faltan algunas líneas en app.yml si cambias de opinión después de la configuración y quieres usar el correo electrónico después de todo.
No estoy tan familiarizado con la forma en que han cambiado las cosas desde Self-Hosting Discourse Just Got a Whole Lot Easier, pero en mis sitios la forma en que se configuran los detalles de SMTP en app.yml no ha cambiado. Si yo fuera tú, intentaría ejecutar
cd /var/discourse
./discourse-doctor
y ver si eso te permite solucionarlo. Si eso no funciona, entonces buscaría un app.yml de un sitio que funcione y lo usaría como ejemplo para asegurarme de que las líneas necesarias para el correo electrónico estén presentes y sean correctas. Si no tienes eso, puedes obtener un ejemplo aquí:
Luego reconstruir.
Si todo esto te parece difícil, si no es demasiado tarde, también puedes empezar de nuevo y responder las preguntas correctamente con tus detalles de SMTP desde el principio.