Parece que faltam algumas linhas no app.yml se você mudar de ideia após a configuração e decidir usar e-mail, afinal.
Não estou muito familiarizado com a forma como as coisas mudaram desde Self-Hosting Discourse Just Got a Whole Lot Easier, mas nos meus sites a forma como os detalhes de SMTP são configurados no app.yml não mudou. Se eu fosse você, tentaria executar
cd /var/discourse
./discourse-doctor
e ver se isso permite que você corrija. Se isso não funcionar, eu procuraria um app.yml de um site funcionando e o usaria como exemplo para garantir que as linhas necessárias para o e-mail estejam presentes e corretas. Se você não tiver isso, pode obter um exemplo aqui:
Em seguida, reconstrua.
Se tudo isso parecer difícil, se não for tarde demais, você também pode começar de novo e responder às perguntas corretamente com seus detalhes de SMTP desde o início.