Então, se entendi corretamente, parece que existem alguns bugs diferentes aqui.
No meu exemplo, também era uma postagem marcada e parece que você obteve o mesmo resultado ao marcar uma postagem: não encontrá-la com in:bookmarks in:title (mas funciona com cada filtro individualmente). Vamos chamar isso de bug1.
Mas parece que você encontrou um bug diferente: um tópico marcado não aparecendo apenas com in:bookmarks — acho que isso parece ainda mais estranho? Suponho que alguém poderia argumentar (não que eu concordaria) que uma postagem marcada talvez não devesse retornar para uma pesquisa com o título do tópico e in:bookmarks, já que o título não está na postagem marcada em si (mas no tópico). Mas não retornar uma correspondência para o título de um tópico marcado e in: bookmarks parece que algo está errado também, especialmente porque funciona para postagens marcadas.
Enquanto estou aqui, se alguém der uma olhada no código de marcadores para isso, talvez dê uma olhada em outra questão relacionada a marcadores que relatei recentemente, que é o motivo pelo qual tenho investigado o recurso de marcadores.