Si tienes espacio en disco y un docker actualizado, probablemente estarás bien.
Si tienes un sistema operativo desactualizado y eso te obliga a tener un docker antiguo, deberías iniciar una nueva máquina virtual y moverte a ella como se describe en Mover un sitio de Discourse a otro VPS con rsync.
Estoy bastante seguro de que al menos la mayoría de las personas que han tenido problemas tienen versiones de Docker desactualizadas, la mayoría de las cuales son causadas por versiones de sistemas operativos desactualizadas.
Si inicias una nueva máquina virtual, nada puede salir mal ya que tu servidor antiguo seguirá estando disponible.