Concordo que o recurso de ignorar/silenciar usuário poderia ser mais refinado, achei um pouco desajeitado, então geralmente não o uso.
O que você descreveu parece um bug, no entanto, tecnicamente, se você está ignorando alguém, isso realmente significa que você não leu nada que está sendo ignorado, então é preciso que os tópicos ainda sejam listados como não totalmente lidos.