ああ、今わかりました。embedMaxHeight の目的は、コメントをよりネイティブなスタイルで表示し、可能な限りスクロールを最小限に抑えること(スレッドが長大な場合はまだスクロールが必要になりますが)だと誤解していました。そのため、15000px に設定していました。少し減らします。
embedMaxHeight
その場合、embedMinHeight が意図通りに機能していないのではないかと思います。400px に設定していても、埋め込みの高さは少なくとも 600px あり、最後に小さな隙間が残っています。
embedMinHeight