Das ist der richtige Weg 
Nicht kopieren/forken von GitHub.
Und wie üblich gibt es einen Haken. Für mich jedenfalls — wenn die WordPress-Welt vertraut ist, ist die Frage sehr ähnlich wie die, ob man functions.php für themenabhängige Änderungen verwenden sollte, etwas wie Code-Snippets, wenn die Änderung nicht themenabhängig ist, oder ein Child-Theme, wenn das Thema oder Plugin bearbeitet werden muss; und wenn ein Child-Theme verwendet wird, verliert man Updates dieses Teils.