Por leituras fantasmas, você quer dizer que não há realmente nada não lido, apenas uma contagem errada?
Recentemente, vi casos do oposto em várias instâncias do Discourse: definitivamente havia mensagens não lidas, e a contagem estava correta, mas a página “não lidas” simplesmente não as mostrava.
Isso parece ser um bug diferente do que está sendo discutido aqui, mas meu relatório de bug foi fechado como duplicata deste.