Atualização do 3.1.0.beta2 para a última beta falhou

Você quer dizer que tentou a atualização pela interface web e ela falhou?

Sim, uma reconstrução pela linha de comando é necessária. Quase nunca é uma má ideia fazer uma reconstrução pela linha de comando, especialmente se outra coisa não funcionou.

A versão atual é 3.1.0.beta4.